Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

Predictions only

Length 1,123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
USP43Q70EL4 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.1 ms