Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SFT2D3Q587I9 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SFT2D3Q587I9 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SFT2D3Q587I9 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SFT2D3Q587I9 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SFT2D3Q587I9 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SFT2D3Q587I9 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SFT2D3Q587I9 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SFT2D3Q587I9 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SFT2D3Q587I9 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SFT2D3Q587I9 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SFT2D3Q587I9 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
SFT2D3Q587I9 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
SFT2D3Q587I9 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
SFT2D3Q587I9 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SFT2D3Q587I9 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SFT2D3Q587I9 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SFT2D3Q587I9 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
SFT2D3Q587I9 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
SFT2D3Q587I9 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SFT2D3Q587I9 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SFT2D3Q587I9 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SFT2D3Q587I9 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SFT2D3Q587I9 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SFT2D3Q587I9 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SFT2D3Q587I9 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SFT2D3Q587I9 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SFT2D3Q587I9 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SFT2D3Q587I9 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SFT2D3Q587I9 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SFT2D3Q587I9 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SFT2D3Q587I9 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SFT2D3Q587I9 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SFT2D3Q587I9 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SFT2D3Q587I9 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SFT2D3Q587I9 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
SFT2D3Q587I9 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
SFT2D3Q587I9 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
SFT2D3Q587I9 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SFT2D3Q587I9 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SFT2D3Q587I9 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
SFT2D3Q587I9 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
SFT2D3Q587I9 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SFT2D3Q587I9 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SFT2D3Q587I9 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SFT2D3Q587I9 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SFT2D3Q587I9 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SFT2D3Q587I9 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SFT2D3Q587I9 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SFT2D3Q587I9 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC0.88□□□□□ -2.27
SFT2D3Q587I9 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SFT2D3Q587I9 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SFT2D3Q587I9 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SFT2D3Q587I9 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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