Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
HIF1AQ16665 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
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