Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CNGA3Q16281 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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