Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC0.19□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC0.18□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC0.18□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC0.17□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.15□□□□□ -2.38
VAMP3Q15836 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 RNU6-117P-201ENST00000365415 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC0.14□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC0.14□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC0.13□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
VAMP3Q15836 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
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