Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC85BQ15834 PRKACB-217ENST00000610457 4206 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC85BQ15834 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC85BQ15834 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC85BQ15834 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC85BQ15834 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC85BQ15834 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC85BQ15834 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC85BQ15834 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC85BQ15834 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC85BQ15834 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC85BQ15834 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC85BQ15834 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC85BQ15834 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC85BQ15834 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC85BQ15834 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC85BQ15834 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC85BQ15834 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC85BQ15834 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC85BQ15834 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC85BQ15834 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC85BQ15834 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC85BQ15834 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC85BQ15834 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC85BQ15834 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CCDC85BQ15834 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
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