Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC-0.29□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 AL136980.1-201ENST00000426764 543 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 AC104260.1-201ENST00000616660 539 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC-0.34□□□□□ -2.46
TAF1AQ15573 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
TAF1AQ15573 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
TAF1AQ15573 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
TAF1AQ15573 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
TAF1AQ15573 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
TAF1AQ15573 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
TAF1AQ15573 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
TAF1AQ15573 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
TAF1AQ15573 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
TAF1AQ15573 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
TAF1AQ15573 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
TAF1AQ15573 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
TAF1AQ15573 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
TAF1AQ15573 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
TAF1AQ15573 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
TAF1AQ15573 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
TAF1AQ15573 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
TAF1AQ15573 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
TAF1AQ15573 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
TAF1AQ15573 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
TAF1AQ15573 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC-0.36□□□□□ -2.47
TAF1AQ15573 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
TAF1AQ15573 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
TAF1AQ15573 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
TAF1AQ15573 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
TAF1AQ15573 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
TAF1AQ15573 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
TAF1AQ15573 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
TAF1AQ15573 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
TAF1AQ15573 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
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