Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PDCD1Q15116 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PDCD1Q15116 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PDCD1Q15116 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PDCD1Q15116 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PDCD1Q15116 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PDCD1Q15116 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PDCD1Q15116 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PDCD1Q15116 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PDCD1Q15116 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PDCD1Q15116 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PDCD1Q15116 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PDCD1Q15116 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PDCD1Q15116 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PDCD1Q15116 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PDCD1Q15116 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PDCD1Q15116 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PDCD1Q15116 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PDCD1Q15116 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PDCD1Q15116 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PDCD1Q15116 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PDCD1Q15116 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PDCD1Q15116 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PDCD1Q15116 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PDCD1Q15116 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PDCD1Q15116 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PDCD1Q15116 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
PDCD1Q15116 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PDCD1Q15116 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PDCD1Q15116 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PDCD1Q15116 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PDCD1Q15116 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PDCD1Q15116 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
PDCD1Q15116 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
PDCD1Q15116 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PDCD1Q15116 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PDCD1Q15116 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PDCD1Q15116 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PDCD1Q15116 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PDCD1Q15116 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PDCD1Q15116 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PDCD1Q15116 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PDCD1Q15116 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PDCD1Q15116 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PDCD1Q15116 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PDCD1Q15116 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PDCD1Q15116 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PDCD1Q15116 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PDCD1Q15116 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PDCD1Q15116 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PDCD1Q15116 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PDCD1Q15116 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PDCD1Q15116 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PDCD1Q15116 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PDCD1Q15116 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PDCD1Q15116 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PDCD1Q15116 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PDCD1Q15116 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PDCD1Q15116 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PDCD1Q15116 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PDCD1Q15116 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PDCD1Q15116 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PDCD1Q15116 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PDCD1Q15116 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PDCD1Q15116 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PDCD1Q15116 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PDCD1Q15116 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PDCD1Q15116 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PDCD1Q15116 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PDCD1Q15116 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PDCD1Q15116 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PDCD1Q15116 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PDCD1Q15116 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PDCD1Q15116 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PDCD1Q15116 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PDCD1Q15116 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PDCD1Q15116 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PDCD1Q15116 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PDCD1Q15116 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PDCD1Q15116 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PDCD1Q15116 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PDCD1Q15116 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PDCD1Q15116 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PDCD1Q15116 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PDCD1Q15116 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PDCD1Q15116 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PDCD1Q15116 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PDCD1Q15116 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PDCD1Q15116 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PDCD1Q15116 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PDCD1Q15116 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PDCD1Q15116 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PDCD1Q15116 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PDCD1Q15116 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
PDCD1Q15116 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PDCD1Q15116 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PDCD1Q15116 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PDCD1Q15116 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PDCD1Q15116 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PDCD1Q15116 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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