Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 VSTM2A-OT1-201ENST00000456049 3031 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 RNU6-1231P-201ENST00000517185 103 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
PCOLCEQ15113 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PCOLCEQ15113 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PCOLCEQ15113 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PCOLCEQ15113 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PCOLCEQ15113 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PCOLCEQ15113 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PCOLCEQ15113 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PCOLCEQ15113 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PCOLCEQ15113 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PCOLCEQ15113 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PCOLCEQ15113 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PCOLCEQ15113 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PCOLCEQ15113 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PCOLCEQ15113 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PCOLCEQ15113 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PCOLCEQ15113 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PCOLCEQ15113 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PCOLCEQ15113 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PCOLCEQ15113 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
PCOLCEQ15113 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
PCOLCEQ15113 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PCOLCEQ15113 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
PCOLCEQ15113 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
PCOLCEQ15113 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PCOLCEQ15113 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PCOLCEQ15113 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PCOLCEQ15113 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PCOLCEQ15113 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PCOLCEQ15113 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PCOLCEQ15113 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PCOLCEQ15113 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PCOLCEQ15113 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PCOLCEQ15113 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PCOLCEQ15113 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PCOLCEQ15113 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PCOLCEQ15113 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PCOLCEQ15113 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PCOLCEQ15113 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PCOLCEQ15113 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PCOLCEQ15113 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PCOLCEQ15113 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PCOLCEQ15113 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PCOLCEQ15113 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PCOLCEQ15113 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PCOLCEQ15113 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PCOLCEQ15113 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PCOLCEQ15113 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PCOLCEQ15113 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms