Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
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SNX17Q15036 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
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SNX17Q15036 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SNX17Q15036 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SNX17Q15036 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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SNX17Q15036 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
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SNX17Q15036 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
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SNX17Q15036 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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SNX17Q15036 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
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SNX17Q15036 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
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SNX17Q15036 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SNX17Q15036 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SNX17Q15036 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
SNX17Q15036 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
SNX17Q15036 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
SNX17Q15036 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SNX17Q15036 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
SNX17Q15036 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SNX17Q15036 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
SNX17Q15036 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SNX17Q15036 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SNX17Q15036 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SNX17Q15036 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SNX17Q15036 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
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