Protein–RNA interactions for Protein: Q15025

TNIP1, TNFAIP3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1Q15025 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TNIP1Q15025 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TNIP1Q15025 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TNIP1Q15025 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TNIP1Q15025 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TNIP1Q15025 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TNIP1Q15025 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TNIP1Q15025 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TNIP1Q15025 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
TNIP1Q15025 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TNIP1Q15025 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TNIP1Q15025 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TNIP1Q15025 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TNIP1Q15025 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TNIP1Q15025 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TNIP1Q15025 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TNIP1Q15025 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TNIP1Q15025 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TNIP1Q15025 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TNIP1Q15025 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TNIP1Q15025 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TNIP1Q15025 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TNIP1Q15025 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TNIP1Q15025 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TNIP1Q15025 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TNIP1Q15025 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TNIP1Q15025 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TNIP1Q15025 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TNIP1Q15025 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TNIP1Q15025 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TNIP1Q15025 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
TNIP1Q15025 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
TNIP1Q15025 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TNIP1Q15025 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TNIP1Q15025 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TNIP1Q15025 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TNIP1Q15025 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TNIP1Q15025 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TNIP1Q15025 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TNIP1Q15025 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TNIP1Q15025 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TNIP1Q15025 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TNIP1Q15025 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TNIP1Q15025 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TNIP1Q15025 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TNIP1Q15025 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TNIP1Q15025 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TNIP1Q15025 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TNIP1Q15025 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TNIP1Q15025 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TNIP1Q15025 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TNIP1Q15025 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TNIP1Q15025 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TNIP1Q15025 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TNIP1Q15025 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TNIP1Q15025 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TNIP1Q15025 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TNIP1Q15025 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TNIP1Q15025 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TNIP1Q15025 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TNIP1Q15025 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TNIP1Q15025 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TNIP1Q15025 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TNIP1Q15025 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TNIP1Q15025 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TNIP1Q15025 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TNIP1Q15025 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TNIP1Q15025 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
TNIP1Q15025 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TNIP1Q15025 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TNIP1Q15025 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TNIP1Q15025 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TNIP1Q15025 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TNIP1Q15025 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TNIP1Q15025 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TNIP1Q15025 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TNIP1Q15025 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TNIP1Q15025 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TNIP1Q15025 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TNIP1Q15025 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TNIP1Q15025 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TNIP1Q15025 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
TNIP1Q15025 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
TNIP1Q15025 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
TNIP1Q15025 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TNIP1Q15025 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TNIP1Q15025 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TNIP1Q15025 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TNIP1Q15025 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TNIP1Q15025 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TNIP1Q15025 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TNIP1Q15025 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
TNIP1Q15025 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TNIP1Q15025 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TNIP1Q15025 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TNIP1Q15025 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TNIP1Q15025 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TNIP1Q15025 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
TNIP1Q15025 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
TNIP1Q15025 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.2 ms