Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.54□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
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COL19A1Q14993 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
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COL19A1Q14993 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
COL19A1Q14993 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
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COL19A1Q14993 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
COL19A1Q14993 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
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