| SEMA3A | Q14563 | RNU6-965P-201 | ENST00000516721 | 96 nt | BASIC | 2.42 | □□□□□ -2.02 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU7-193P-201 | ENST00000516723 | 65 nt | BASIC | 2.42 | □□□□□ -2.02 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC107886.1-201 | ENST00000526935 | 516 nt | TSL 3 BASIC | 2.42 | □□□□□ -2.02 | | |
| SEMA3A | Q14563 | CARD18-203 | ENST00000532895 | 422 nt | TSL 2 BASIC | 2.42 | □□□□□ -2.02 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC018630.3-201 | ENST00000542637 | 96 nt | BASIC | 2.42 | □□□□□ -2.02 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC009107.1-201 | ENST00000561923 | 330 nt | TSL 3 BASIC | 2.42 | □□□□□ -2.02 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC104465.1-201 | ENST00000611365 | 139 nt | BASIC | 2.42 | □□□□□ -2.02 | | |
| SEMA3A | Q14563 | KCNQ1OT1_5.1-201 | ENST00000621902 | 226 nt | BASIC | 2.42 | □□□□□ -2.02 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC006001.4-201 | ENST00000622243 | 395 nt | BASIC | 2.42 | □□□□□ -2.02 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC091932.3-201 | ENST00000624223 | 323 nt | BASIC | 2.42 | □□□□□ -2.02 | | |
| SEMA3A | Q14563 | KTN1-203 | ENST00000395309 | 4021 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.42 | □□□□□ -2.02 | | |
| SEMA3A | Q14563 | FAR1-204 | ENST00000532502 | 5820 nt | TSL 2 BASIC | 2.41 | □□□□□ -2.02 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-727P-201 | ENST00000363592 | 107 nt | BASIC | 2.41 | □□□□□ -2.02 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.233-201 | ENST00000364407 | 101 nt | BASIC | 2.41 | □□□□□ -2.02 | | |
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| SEMA3A | Q14563 | AL590399.1-203 | ENST00000412631 | 256 nt | TSL 5 BASIC | 2.41 | □□□□□ -2.02 | | |
| SEMA3A | Q14563 | OOSP1P1-201 | ENST00000423265 | 274 nt | BASIC | 2.41 | □□□□□ -2.02 | | |
| SEMA3A | Q14563 | POLR2KP2-201 | ENST00000438155 | 177 nt | BASIC | 2.41 | □□□□□ -2.02 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU7-14P-201 | ENST00000459331 | 62 nt | BASIC | 2.41 | □□□□□ -2.02 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC097501.2-201 | ENST00000502668 | 305 nt | TSL 5 BASIC | 2.41 | □□□□□ -2.02 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MIR449C-201 | ENST00000516047 | 92 nt | BASIC | 2.41 | □□□□□ -2.02 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-1278P-201 | ENST00000516130 | 107 nt | BASIC | 2.41 | □□□□□ -2.02 | | |
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| SEMA3A | Q14563 | AC233702.2-202 | ENST00000562547 | 291 nt | BASIC | 2.41 | □□□□□ -2.02 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MIR3162-201 | ENST00000581818 | 82 nt | BASIC | 2.41 | □□□□□ -2.02 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC072026.1-201 | ENST00000605023 | 201 nt | BASIC | 2.41 | □□□□□ -2.02 | | |
| SEMA3A | Q14563 | TTC28-AS1_2.1-201 | ENST00000611117 | 157 nt | BASIC | 2.41 | □□□□□ -2.02 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MTND5P35-201 | ENST00000557537 | 1720 nt | BASIC | 2.41 | □□□□□ -2.02 | | |
| SEMA3A | Q14563 | C6orf10-201 | ENST00000375007 | 2125 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.41 | □□□□□ -2.02 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC080100.1-201 | ENST00000624239 | 5356 nt | BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.02 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RMDN2-203 | ENST00000402091 | 1973 nt | TSL 2 BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.02 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.8-201 | ENST00000362353 | 102 nt | BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.240-201 | ENST00000364469 | 95 nt | BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-438P-201 | ENST00000365561 | 103 nt | BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL359511.1-201 | ENST00000402970 | 211 nt | BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-1135P-201 | ENST00000411083 | 103 nt | BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU5E-9P-201 | ENST00000411164 | 104 nt | BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL606753.1-201 | ENST00000427435 | 87 nt | BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RAB28P5-201 | ENST00000427490 | 651 nt | BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC069023.1-201 | ENST00000442231 | 221 nt | TSL 3 BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC010255.2-201 | ENST00000505209 | 428 nt | TSL 3 BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-191P-201 | ENST00000516295 | 94 nt | BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-344P-201 | ENST00000516635 | 111 nt | BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | DEFB131C-201 | ENST00000528817 | 165 nt | BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | DEFB131B-201 | ENST00000530210 | 213 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC037487.3-201 | ENST00000606668 | 112 nt | BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SNORD11B-201 | ENST00000607707 | 90 nt | BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC004467.1-201 | ENST00000615678 | 330 nt | BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | snoU18.1-201 | ENST00000629629 | 71 nt | BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | PCDH11Y-203 | ENST00000362095 | 4220 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | THOC2-216 | ENST00000491737 | 4452 nt | TSL 5 BASIC | 2.4 | □□□□□ -2.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | OR2L2-203 | ENST00000642011 | 4225 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-653P-201 | ENST00000363074 | 106 nt | BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU1-91P-201 | ENST00000364746 | 163 nt | BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SNORD113-1-201 | ENST00000365321 | 69 nt | BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU1-51P-201 | ENST00000365345 | 176 nt | BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.398-201 | ENST00000383952 | 99 nt | BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | TRDJ2-201 | ENST00000390475 | 54 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL357139.1-201 | ENST00000407792 | 426 nt | BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-394P-201 | ENST00000410735 | 107 nt | BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC009238.1-201 | ENST00000442165 | 424 nt | BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC009237.6-201 | ENST00000446969 | 424 nt | BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC074290.1-201 | ENST00000448883 | 135 nt | BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-625P-201 | ENST00000459412 | 107 nt | BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC074133.1-201 | ENST00000515696 | 183 nt | BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU7-200P-201 | ENST00000516105 | 62 nt | BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-1098P-201 | ENST00000516772 | 96 nt | BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU1-117P-201 | ENST00000517041 | 158 nt | BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MIR3144-201 | ENST00000579460 | 79 nt | BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | DEFB117-201 | ENST00000602356 | 141 nt | BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL008718.3-201 | ENST00000610217 | 321 nt | BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL365265.1-201 | ENST00000621045 | 234 nt | BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | U6.106-201 | ENST00000636360 | 105 nt | BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | hsa-mir-548d-1.1-201 | ENST00000636914 | 97 nt | BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Clostridiales-1.3-201 | ENST00000637703 | 147 nt | BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RICTOR-202 | ENST00000357387 | 9543 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | ATF1-201 | ENST00000262053 | 2181 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.39 | □□□□□ -2.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU1-23P-201 | ENST00000363361 | 144 nt | BASIC | 2.38 | □□□□□ -2.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-743P-201 | ENST00000364151 | 106 nt | BASIC | 2.38 | □□□□□ -2.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-454P-201 | ENST00000364292 | 107 nt | BASIC | 2.38 | □□□□□ -2.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-818P-201 | ENST00000364837 | 108 nt | BASIC | 2.38 | □□□□□ -2.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-211P-201 | ENST00000384047 | 107 nt | BASIC | 2.38 | □□□□□ -2.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-514P-201 | ENST00000384208 | 107 nt | BASIC | 2.38 | □□□□□ -2.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MIR300-201 | ENST00000401138 | 83 nt | BASIC | 2.38 | □□□□□ -2.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MIR548I2-201 | ENST00000408348 | 149 nt | BASIC | 2.38 | □□□□□ -2.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC024067.1-201 | ENST00000426199 | 223 nt | BASIC | 2.38 | □□□□□ -2.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL135790.2-201 | ENST00000437701 | 267 nt | BASIC | 2.38 | □□□□□ -2.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | NDUFB4P10-201 | ENST00000452541 | 359 nt | BASIC | 2.38 | □□□□□ -2.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC005042.3-201 | ENST00000453230 | 174 nt | BASIC | 2.38 | □□□□□ -2.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC091021.1-201 | ENST00000468051 | 388 nt | BASIC | 2.38 | □□□□□ -2.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | APOA2-205 | ENST00000468465 | 421 nt | TSL 2 BASIC | 2.38 | □□□□□ -2.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC097716.1-201 | ENST00000509136 | 180 nt | TSL 2 BASIC | 2.38 | □□□□□ -2.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC026436.1-201 | ENST00000510537 | 270 nt | BASIC | 2.38 | □□□□□ -2.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.662-201 | ENST00000516028 | 97 nt | BASIC | 2.38 | □□□□□ -2.03 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNA5SP402-201 | ENST00000517148 | 110 nt | BASIC | 2.38 | □□□□□ -2.03 | | |