| CSHL1 | Q14406 | AC127459.3-201 | ENST00000624328 | 466 nt | BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| CSHL1 | Q14406 | OGN-202 | ENST00000375561 | 2743 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.19 | □□□□□ -2.06 | | |
| CSHL1 | Q14406 | MTND5P6-201 | ENST00000422338 | 1798 nt | BASIC | 2.18 | □□□□□ -2.06 | | |
| CSHL1 | Q14406 | AC010615.1-201 | ENST00000594254 | 1764 nt | BASIC | 2.18 | □□□□□ -2.06 | | |
| CSHL1 | Q14406 | SNORA27.1-201 | ENST00000362604 | 124 nt | BASIC | 2.18 | □□□□□ -2.06 | | |
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| CSHL1 | Q14406 | SNORA33-201 | ENST00000363664 | 130 nt | BASIC | 2.18 | □□□□□ -2.06 | | |
| CSHL1 | Q14406 | Y_RNA.361-201 | ENST00000365515 | 120 nt | BASIC | 2.18 | □□□□□ -2.06 | | |
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| CSHL1 | Q14406 | Y_RNA.483-201 | ENST00000384380 | 101 nt | BASIC | 2.18 | □□□□□ -2.06 | | |
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| CSHL1 | Q14406 | RNA5SP450-201 | ENST00000411206 | 102 nt | BASIC | 2.18 | □□□□□ -2.06 | | |
| CSHL1 | Q14406 | AC099677.2-201 | ENST00000436385 | 175 nt | BASIC | 2.18 | □□□□□ -2.06 | | |
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| CSHL1 | Q14406 | C6orf10-201 | ENST00000375007 | 2125 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.17 | □□□□□ -2.06 | | |
| CSHL1 | Q14406 | RNU4-82P-201 | ENST00000362443 | 140 nt | BASIC | 2.17 | □□□□□ -2.06 | | |
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| CSHL1 | Q14406 | SUMO1P2-201 | ENST00000452524 | 304 nt | BASIC | 2.17 | □□□□□ -2.06 | | |
| CSHL1 | Q14406 | RNA5SP20-201 | ENST00000515976 | 84 nt | BASIC | 2.17 | □□□□□ -2.06 | | |
| CSHL1 | Q14406 | RNU2-19P-201 | ENST00000517288 | 84 nt | BASIC | 2.17 | □□□□□ -2.06 | | |
| CSHL1 | Q14406 | AL137100.2-201 | ENST00000555786 | 315 nt | BASIC | 2.17 | □□□□□ -2.06 | | |
| CSHL1 | Q14406 | AL122017.1-202 | ENST00000570612 | 319 nt | TSL 5 BASIC | 2.17 | □□□□□ -2.06 | | |
| CSHL1 | Q14406 | 5S_rRNA.11-201 | ENST00000618635 | 84 nt | BASIC | 2.17 | □□□□□ -2.06 | | |
| CSHL1 | Q14406 | AC006435.5-201 | ENST00000624486 | 112 nt | BASIC | 2.17 | □□□□□ -2.06 | | |
| CSHL1 | Q14406 | HAS2-201 | ENST00000303924 | 4190 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.17 | □□□□□ -2.06 | | |
| CSHL1 | Q14406 | CLLU1-201 | ENST00000378485 | 3897 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.16 | □□□□□ -2.06 | | |
| CSHL1 | Q14406 | MIR449A-201 | ENST00000362113 | 91 nt | BASIC | 2.16 | □□□□□ -2.06 | | |
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| CSHL1 | Q14406 | RNU6-505P-201 | ENST00000384427 | 107 nt | BASIC | 2.16 | □□□□□ -2.06 | | |
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| CSHL1 | Q14406 | AC055731.1-201 | ENST00000474387 | 401 nt | BASIC | 2.16 | □□□□□ -2.06 | | |
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| CSHL1 | Q14406 | AC103794.1-201 | ENST00000531763 | 197 nt | TSL 3 BASIC | 2.16 | □□□□□ -2.06 | | |
| CSHL1 | Q14406 | MIR4438-201 | ENST00000585271 | 93 nt | BASIC | 2.16 | □□□□□ -2.06 | | |
| CSHL1 | Q14406 | AP001282.2-201 | ENST00000616149 | 309 nt | BASIC | 2.16 | □□□□□ -2.06 | | |
| CSHL1 | Q14406 | 7SK.10-201 | ENST00000621414 | 298 nt | BASIC | 2.16 | □□□□□ -2.06 | | |
| CSHL1 | Q14406 | MUC15-202 | ENST00000436318 | 3118 nt | TSL 5 BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.06 | | |
| CSHL1 | Q14406 | CENPCP1-201 | ENST00000533085 | 2578 nt | BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.06 | | |
| CSHL1 | Q14406 | LCORL-202 | ENST00000382224 | 4984 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.06 | | |
| CSHL1 | Q14406 | ZBTB6-201 | ENST00000373659 | 4106 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | PPP2R5A-205 | ENST00000537030 | 1719 nt | TSL 2 BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | RNU4-80P-201 | ENST00000363200 | 141 nt | BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | RNU6-271P-201 | ENST00000363858 | 105 nt | BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | Y_RNA.418-201 | ENST00000384029 | 102 nt | BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | RNU6-463P-201 | ENST00000384340 | 107 nt | BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | Y_RNA.500-201 | ENST00000384466 | 111 nt | BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | TRAJ50-201 | ENST00000390487 | 60 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | RNU6-1186P-201 | ENST00000410429 | 97 nt | BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | RNA5SP501-201 | ENST00000410990 | 112 nt | BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | AL592431.2-201 | ENST00000422198 | 171 nt | TSL 3 BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | LINC01766-201 | ENST00000453968 | 362 nt | TSL 3 BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | RPS26P55-201 | ENST00000471178 | 356 nt | BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | SNORA70.12-201 | ENST00000516084 | 153 nt | BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | RNVU1-2-201 | ENST00000516326 | 135 nt | BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | SCARNA24.2-201 | ENST00000516968 | 130 nt | BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | AC012435.2-201 | ENST00000562869 | 361 nt | TSL 3 BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | MIR5094-201 | ENST00000578766 | 85 nt | BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | MIR6840-201 | ENST00000611937 | 71 nt | BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | Hammerhead_HH9.1-201 | ENST00000616606 | 77 nt | BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | U6.73-201 | ENST00000619194 | 103 nt | BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | MIR6132-201 | ENST00000622083 | 109 nt | BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | NAA50-211 | ENST00000630058 | 177 nt | TSL 5 BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | USP53-202 | ENST00000450251 | 6072 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | TTK-202 | ENST00000369798 | 3010 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 2.15 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | LRRCC1-202 | ENST00000414626 | 4493 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 2.14 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | SNORA16B-201 | ENST00000364674 | 135 nt | BASIC | 2.14 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | CST2P1-201 | ENST00000425770 | 87 nt | BASIC | 2.14 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | AC116666.1-201 | ENST00000453915 | 551 nt | TSL 5 BASIC | 2.14 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | AC007229.1-201 | ENST00000590455 | 412 nt | BASIC | 2.14 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | SNORD114-7-201 | ENST00000362520 | 77 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | Y_RNA.237-201 | ENST00000364439 | 102 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | SNORA53-201 | ENST00000391141 | 249 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | SNORA11.4-201 | ENST00000408823 | 129 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | EBAG9P1-201 | ENST00000418955 | 543 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | AC008892.1-201 | ENST00000511861 | 384 nt | TSL 3 BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | AC097462.1-201 | ENST00000514125 | 324 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
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| CSHL1 | Q14406 | RNU6-63P-201 | ENST00000516690 | 95 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | RNU2-31P-201 | ENST00000516954 | 155 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | AC107973.1-201 | ENST00000530249 | 576 nt | TSL 4 BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | AP001363.1-201 | ENST00000544108 | 264 nt | TSL 3 BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | MIR5694-201 | ENST00000581190 | 76 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |
| CSHL1 | Q14406 | MIR5002-201 | ENST00000584713 | 97 nt | BASIC | 2.13 | □□□□□ -2.07 | | |