Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
COL9A3Q14050 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 CACNB4-260ENST00000637762 3800 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
COL9A3Q14050 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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