Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
EXOSC2Q13868 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
EXOSC2Q13868 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
EXOSC2Q13868 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
EXOSC2Q13868 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
EXOSC2Q13868 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
EXOSC2Q13868 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
EXOSC2Q13868 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
EXOSC2Q13868 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
EXOSC2Q13868 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
EXOSC2Q13868 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
EXOSC2Q13868 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
EXOSC2Q13868 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
EXOSC2Q13868 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
EXOSC2Q13868 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
EXOSC2Q13868 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
EXOSC2Q13868 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
EXOSC2Q13868 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
EXOSC2Q13868 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
EXOSC2Q13868 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
EXOSC2Q13868 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
EXOSC2Q13868 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
EXOSC2Q13868 AC092794.2-201ENST00000620933 563 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
EXOSC2Q13868 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
EXOSC2Q13868 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
EXOSC2Q13868 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
EXOSC2Q13868 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
EXOSC2Q13868 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
EXOSC2Q13868 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
EXOSC2Q13868 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
EXOSC2Q13868 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
EXOSC2Q13868 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
EXOSC2Q13868 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
EXOSC2Q13868 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
EXOSC2Q13868 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
EXOSC2Q13868 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
EXOSC2Q13868 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
EXOSC2Q13868 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
EXOSC2Q13868 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
EXOSC2Q13868 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
EXOSC2Q13868 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
EXOSC2Q13868 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
EXOSC2Q13868 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
EXOSC2Q13868 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
EXOSC2Q13868 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
EXOSC2Q13868 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
EXOSC2Q13868 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
EXOSC2Q13868 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
EXOSC2Q13868 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
EXOSC2Q13868 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
EXOSC2Q13868 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
EXOSC2Q13868 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
EXOSC2Q13868 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
EXOSC2Q13868 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
EXOSC2Q13868 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
EXOSC2Q13868 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
EXOSC2Q13868 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
EXOSC2Q13868 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
EXOSC2Q13868 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
EXOSC2Q13868 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
EXOSC2Q13868 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
EXOSC2Q13868 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
EXOSC2Q13868 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
EXOSC2Q13868 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
EXOSC2Q13868 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
EXOSC2Q13868 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
EXOSC2Q13868 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
EXOSC2Q13868 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
EXOSC2Q13868 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
EXOSC2Q13868 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
EXOSC2Q13868 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
EXOSC2Q13868 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
EXOSC2Q13868 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
EXOSC2Q13868 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
EXOSC2Q13868 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
EXOSC2Q13868 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
EXOSC2Q13868 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
EXOSC2Q13868 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
EXOSC2Q13868 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
EXOSC2Q13868 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
EXOSC2Q13868 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
EXOSC2Q13868 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
EXOSC2Q13868 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
EXOSC2Q13868 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
EXOSC2Q13868 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
EXOSC2Q13868 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
EXOSC2Q13868 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
EXOSC2Q13868 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
EXOSC2Q13868 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
EXOSC2Q13868 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
EXOSC2Q13868 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
EXOSC2Q13868 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
EXOSC2Q13868 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
EXOSC2Q13868 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
EXOSC2Q13868 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
EXOSC2Q13868 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
EXOSC2Q13868 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
EXOSC2Q13868 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
EXOSC2Q13868 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
EXOSC2Q13868 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.8 ms