Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC-1.19□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC-1.2□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-1.2□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC-1.2□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC-1.2□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC-1.2□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC-1.2□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC-1.21□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC-1.21□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC-1.21□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC-1.21□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC-1.21□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC-1.22□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC-1.22□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC-1.22□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
SPTAN1Q13813 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC-1.23□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC-1.23□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC-1.23□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC-1.23□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
SPTAN1Q13813 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
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