Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
RUNX3Q13761 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC1.56□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 RNU6-856P-201ENST00000516959 98 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RUNX3Q13761 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.4 ms