Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
HDAC1Q13547 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
HDAC1Q13547 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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