Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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TUBB3Q13509 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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TUBB3Q13509 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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TUBB3Q13509 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
TUBB3Q13509 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TUBB3Q13509 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
TUBB3Q13509 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
TUBB3Q13509 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TUBB3Q13509 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TUBB3Q13509 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TUBB3Q13509 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TUBB3Q13509 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TUBB3Q13509 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TUBB3Q13509 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TUBB3Q13509 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
TUBB3Q13509 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TUBB3Q13509 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TUBB3Q13509 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
TUBB3Q13509 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TUBB3Q13509 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TUBB3Q13509 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TUBB3Q13509 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TUBB3Q13509 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TUBB3Q13509 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TUBB3Q13509 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TUBB3Q13509 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TUBB3Q13509 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TUBB3Q13509 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TUBB3Q13509 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TUBB3Q13509 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TUBB3Q13509 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TUBB3Q13509 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TUBB3Q13509 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TUBB3Q13509 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TUBB3Q13509 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TUBB3Q13509 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
TUBB3Q13509 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TUBB3Q13509 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TUBB3Q13509 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
TUBB3Q13509 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
TUBB3Q13509 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
TUBB3Q13509 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TUBB3Q13509 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TUBB3Q13509 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TUBB3Q13509 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TUBB3Q13509 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TUBB3Q13509 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TUBB3Q13509 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TUBB3Q13509 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TUBB3Q13509 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TUBB3Q13509 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
TUBB3Q13509 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
TUBB3Q13509 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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