Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
TCIRG1Q13488 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
TCIRG1Q13488 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TCIRG1Q13488 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TCIRG1Q13488 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TCIRG1Q13488 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TCIRG1Q13488 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
TCIRG1Q13488 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
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TCIRG1Q13488 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TCIRG1Q13488 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
TCIRG1Q13488 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TCIRG1Q13488 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
TCIRG1Q13488 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
TCIRG1Q13488 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
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TCIRG1Q13488 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
TCIRG1Q13488 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TCIRG1Q13488 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
TCIRG1Q13488 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
TCIRG1Q13488 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TCIRG1Q13488 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TCIRG1Q13488 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TCIRG1Q13488 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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TCIRG1Q13488 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
TCIRG1Q13488 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TCIRG1Q13488 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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TCIRG1Q13488 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
TCIRG1Q13488 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
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TCIRG1Q13488 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TCIRG1Q13488 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
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TCIRG1Q13488 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
TCIRG1Q13488 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
TCIRG1Q13488 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
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TCIRG1Q13488 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
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TCIRG1Q13488 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
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TCIRG1Q13488 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TCIRG1Q13488 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TCIRG1Q13488 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
TCIRG1Q13488 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
TCIRG1Q13488 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TCIRG1Q13488 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
TCIRG1Q13488 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
TCIRG1Q13488 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
TCIRG1Q13488 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
TCIRG1Q13488 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
TCIRG1Q13488 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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