Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
MSLNQ13421 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
MSLNQ13421 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
MSLNQ13421 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.18
MSLNQ13421 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC1.39□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 RNU6-1156P-201ENST00000410365 100 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
MSLNQ13421 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
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