Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
SGCGQ13326 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SGCGQ13326 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
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