Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.11□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.1□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC0.1□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SRSF6Q13247 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC0.09□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SRSF6Q13247 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.4 ms