Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
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ERCC8Q13216 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
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ERCC8Q13216 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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ERCC8Q13216 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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ERCC8Q13216 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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ERCC8Q13216 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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ERCC8Q13216 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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ERCC8Q13216 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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ERCC8Q13216 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
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ERCC8Q13216 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
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ERCC8Q13216 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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ERCC8Q13216 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
ERCC8Q13216 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
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