Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
RPA4Q13156 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC1.15□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
RPA4Q13156 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
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