Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.96□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 ZNF732-201ENST00000419098 2193 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.94□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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IFT88Q13099 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
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IFT88Q13099 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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IFT88Q13099 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
IFT88Q13099 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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