Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
PTP4A2Q12974 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTP4A2Q12974 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
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