Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
TRAF2Q12933 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
TRAF2Q12933 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
TRAF2Q12933 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
TRAF2Q12933 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
TRAF2Q12933 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TRAF2Q12933 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TRAF2Q12933 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
TRAF2Q12933 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.5 ms