Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LMAN2Q12907 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LMAN2Q12907 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LMAN2Q12907 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
LMAN2Q12907 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
LMAN2Q12907 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
LMAN2Q12907 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
LMAN2Q12907 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
LMAN2Q12907 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
LMAN2Q12907 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
LMAN2Q12907 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.8 ms