Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 AC087499.4-201ENST00000448505 178 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
GRIN2AQ12879 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.82□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
GRIN2AQ12879 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
GRIN2AQ12879 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
GRIN2AQ12879 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
GRIN2AQ12879 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
GRIN2AQ12879 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
GRIN2AQ12879 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
GRIN2AQ12879 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
GRIN2AQ12879 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
GRIN2AQ12879 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143 ms