Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
BPTFQ12830 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
BPTFQ12830 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC-1.03□□□□□ -2.57
BPTFQ12830 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC-1.04□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.05□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
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BPTFQ12830 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
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BPTFQ12830 MIR509-2-201ENST00000390724 91 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC-1.05□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 Z99497.2-201ENST00000603634 310 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 SNORA67.2-201ENST00000384300 149 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
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BPTFQ12830 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC-1.06□□□□□ -2.58
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BPTFQ12830 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC-1.06□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 SNORA74.3-201ENST00000517108 154 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-1.07□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC-1.07□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
BPTFQ12830 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
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