Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC0.39□□□□□ -2.35
TTPAP49638 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TTPAP49638 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC0.39□□□□□ -2.35
TTPAP49638 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TTPAP49638 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TTPAP49638 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TTPAP49638 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
TTPAP49638 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC0.38□□□□□ -2.35
TTPAP49638 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TTPAP49638 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TTPAP49638 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TTPAP49638 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TTPAP49638 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TTPAP49638 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TTPAP49638 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
TTPAP49638 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TTPAP49638 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TTPAP49638 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC0.38□□□□□ -2.35
TTPAP49638 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TTPAP49638 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TTPAP49638 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TTPAP49638 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TTPAP49638 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TTPAP49638 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TTPAP49638 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TTPAP49638 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TTPAP49638 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TTPAP49638 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC0.37□□□□□ -2.35
TTPAP49638 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TTPAP49638 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TTPAP49638 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TTPAP49638 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TTPAP49638 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TTPAP49638 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
TTPAP49638 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TTPAP49638 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TTPAP49638 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
TTPAP49638 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TTPAP49638 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TTPAP49638 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TTPAP49638 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
TTPAP49638 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC0.36□□□□□ -2.35
TTPAP49638 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TTPAP49638 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TTPAP49638 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TTPAP49638 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TTPAP49638 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TTPAP49638 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TTPAP49638 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TTPAP49638 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TTPAP49638 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TTPAP49638 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TTPAP49638 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TTPAP49638 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TTPAP49638 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TTPAP49638 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TTPAP49638 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TTPAP49638 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
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TTPAP49638 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TTPAP49638 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
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TTPAP49638 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TTPAP49638 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TTPAP49638 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TTPAP49638 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
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TTPAP49638 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
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TTPAP49638 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
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TTPAP49638 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TTPAP49638 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TTPAP49638 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TTPAP49638 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
TTPAP49638 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
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TTPAP49638 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
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TTPAP49638 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TTPAP49638 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TTPAP49638 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TTPAP49638 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
TTPAP49638 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TTPAP49638 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TTPAP49638 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TTPAP49638 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
TTPAP49638 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TTPAP49638 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
TTPAP49638 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
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