Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 SNORA28-201ENST00000606769 126 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
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CLDN9O95484 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC0.93□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 RNU7-172P-201ENST00000517125 64 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CLDN9O95484 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
CLDN9O95484 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CLDN9O95484 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CLDN9O95484 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CLDN9O95484 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CLDN9O95484 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CLDN9O95484 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CLDN9O95484 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CLDN9O95484 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CLDN9O95484 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CLDN9O95484 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CLDN9O95484 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CLDN9O95484 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CLDN9O95484 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
CLDN9O95484 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CLDN9O95484 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CLDN9O95484 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CLDN9O95484 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC0.9□□□□□ -2.27
CLDN9O95484 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CLDN9O95484 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
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