Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC-0.88□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BNIP3P26-201ENST00000600827 554 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC-0.92□□□□□ -2.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC-0.92□□□□□ -2.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
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