Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
CIPCQ9C0C6 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 AC016717.1-201ENST00000448918 286 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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