Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

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Length 1,300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SALL3Q9BXA9 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 RNU6-151P-201ENST00000364158 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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SALL3Q9BXA9 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SALL3Q9BXA9 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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