Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ZNF548Q8NEK5 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
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