Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR2

NLRC3, NLR family CARD domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3Q7RTR2 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC3□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
NLRC3Q7RTR2 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NLRC3Q7RTR2 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
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