Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 AC022616.4-201ENST00000522985 181 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CTXN3Q4LDR2 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
CTXN3Q4LDR2 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CTXN3Q4LDR2 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CTXN3Q4LDR2 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CTXN3Q4LDR2 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CTXN3Q4LDR2 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CTXN3Q4LDR2 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CTXN3Q4LDR2 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CTXN3Q4LDR2 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CTXN3Q4LDR2 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CTXN3Q4LDR2 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CTXN3Q4LDR2 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CTXN3Q4LDR2 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CTXN3Q4LDR2 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CTXN3Q4LDR2 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CTXN3Q4LDR2 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CTXN3Q4LDR2 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CTXN3Q4LDR2 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CTXN3Q4LDR2 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CTXN3Q4LDR2 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CTXN3Q4LDR2 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CTXN3Q4LDR2 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CTXN3Q4LDR2 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CTXN3Q4LDR2 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CTXN3Q4LDR2 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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