Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 RNU7-169P-201ENST00000459456 61 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
KNOP1Q1ED39 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 RNU6-797P-201ENST00000363101 109 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 RNU6-1240P-201ENST00000365155 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC1.57□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.55□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
KNOP1Q1ED39 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.3 ms