Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPROQ16827 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPROQ16827 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPROQ16827 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPROQ16827 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPROQ16827 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPROQ16827 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPROQ16827 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPROQ16827 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPROQ16827 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPROQ16827 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPROQ16827 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPROQ16827 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPROQ16827 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPROQ16827 RPS27P22-201ENST00000478056 241 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPROQ16827 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPROQ16827 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPROQ16827 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPROQ16827 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPROQ16827 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPROQ16827 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPROQ16827 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.59□□□□□ -2
PTPROQ16827 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC2.59□□□□□ -2
PTPROQ16827 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
PTPROQ16827 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPROQ16827 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPROQ16827 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPROQ16827 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPROQ16827 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPROQ16827 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPROQ16827 RNU5A-5P-201ENST00000411054 116 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPROQ16827 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPROQ16827 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPROQ16827 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPROQ16827 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPROQ16827 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPROQ16827 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPROQ16827 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPROQ16827 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.58□□□□□ -2
PTPROQ16827 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
PTPROQ16827 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPROQ16827 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPROQ16827 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPROQ16827 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPROQ16827 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPROQ16827 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPROQ16827 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPROQ16827 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPROQ16827 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPROQ16827 MIR4438-201ENST00000585271 93 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPROQ16827 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPROQ16827 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPROQ16827 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
PTPROQ16827 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC2.57□□□□□ -2
PTPROQ16827 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PTPROQ16827 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PTPROQ16827 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPROQ16827 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPROQ16827 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPROQ16827 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPROQ16827 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPROQ16827 RNU2-54P-201ENST00000410299 190 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPROQ16827 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPROQ16827 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPROQ16827 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPROQ16827 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPROQ16827 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPROQ16827 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPROQ16827 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
PTPROQ16827 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPROQ16827 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPROQ16827 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPROQ16827 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
PTPROQ16827 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC2.56□□□□□ -2
PTPROQ16827 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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PTPROQ16827 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPROQ16827 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPROQ16827 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPROQ16827 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPROQ16827 AC097501.2-201ENST00000502668 305 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PTPROQ16827 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPROQ16827 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
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PTPROQ16827 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPROQ16827 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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PTPROQ16827 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PTPROQ16827 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPROQ16827 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPROQ16827 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPROQ16827 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPROQ16827 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPROQ16827 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPROQ16827 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPROQ16827 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPROQ16827 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPROQ16827 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPROQ16827 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PTPROQ16827 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
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