Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC1.48□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC1.48□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 AL160004.2-201ENST00000432935 350 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PCK2Q16822 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PCK2Q16822 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PCK2Q16822 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PCK2Q16822 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PCK2Q16822 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PCK2Q16822 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PCK2Q16822 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PCK2Q16822 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PCK2Q16822 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PCK2Q16822 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PCK2Q16822 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PCK2Q16822 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
PCK2Q16822 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.5 ms