Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 AC073413.2-201ENST00000604332 360 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
HIF1AQ16665 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
HIF1AQ16665 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
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