Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
CTF1Q16619 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 SNORA27.1-201ENST00000362604 124 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
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CTF1Q16619 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
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CTF1Q16619 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 RPS26P55-201ENST00000471178 356 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CTF1Q16619 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
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