Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
ZNF239Q16600 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
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