Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FXNQ16595 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FXNQ16595 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FXNQ16595 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
FXNQ16595 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
FXNQ16595 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
FXNQ16595 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
FXNQ16595 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
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FXNQ16595 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FXNQ16595 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
FXNQ16595 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FXNQ16595 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FXNQ16595 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FXNQ16595 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FXNQ16595 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FXNQ16595 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FXNQ16595 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
FXNQ16595 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FXNQ16595 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FXNQ16595 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
FXNQ16595 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
FXNQ16595 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FXNQ16595 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
FXNQ16595 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
FXNQ16595 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
FXNQ16595 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
FXNQ16595 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FXNQ16595 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FXNQ16595 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FXNQ16595 LINC00583-201ENST00000381010 387 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
FXNQ16595 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FXNQ16595 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FXNQ16595 RNU6-376P-201ENST00000384731 106 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FXNQ16595 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
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FXNQ16595 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FXNQ16595 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FXNQ16595 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
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FXNQ16595 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FXNQ16595 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
FXNQ16595 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FXNQ16595 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FXNQ16595 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FXNQ16595 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FXNQ16595 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FXNQ16595 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
FXNQ16595 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
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FXNQ16595 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
FXNQ16595 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
FXNQ16595 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
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FXNQ16595 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
FXNQ16595 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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FXNQ16595 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
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FXNQ16595 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
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FXNQ16595 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FXNQ16595 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FXNQ16595 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FXNQ16595 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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FXNQ16595 AL353149.1-201ENST00000610667 244 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
FXNQ16595 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
FXNQ16595 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
FXNQ16595 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FXNQ16595 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FXNQ16595 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FXNQ16595 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FXNQ16595 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FXNQ16595 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
FXNQ16595 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FXNQ16595 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
FXNQ16595 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
FXNQ16595 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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