Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 MIR1185-2-201ENST00000408687 86 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CNGA3Q16281 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 RNU6-221P-201ENST00000459541 99 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CNGA3Q16281 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms