Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC3□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC3□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC3□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC3□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC3□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC3□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC3□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC3□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC3□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
VPS72Q15906 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
VPS72Q15906 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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