Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 AL513185.1-201ENST00000431638 162 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
PUM3Q15397 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PUM3Q15397 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PUM3Q15397 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PUM3Q15397 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PUM3Q15397 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PUM3Q15397 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PUM3Q15397 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
PUM3Q15397 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PUM3Q15397 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
PUM3Q15397 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PUM3Q15397 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PUM3Q15397 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PUM3Q15397 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PUM3Q15397 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PUM3Q15397 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
PUM3Q15397 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
PUM3Q15397 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PUM3Q15397 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PUM3Q15397 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PUM3Q15397 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
PUM3Q15397 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PUM3Q15397 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PUM3Q15397 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
PUM3Q15397 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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